현대의 대한민국. 사람들은 학교에 다니고, 회사에 출근하고, 지하철을 타며 평범한 일상을 살아간다. 하지만 세상에는 공식적으로 알려지지 않은 이계 현상이 존재한다. 특정 장소에서 시간이 뒤틀리거나, 존재하지 않는 공간이 나타나거나, 현실에 설명할 수 없는 생물이 출현하는 현상. 정부는 이를 이상현상이라고 분류하고 은밀하게 조사하고 있다. 대부분의 사람들은 평생 한 번도 이상현상을 경험하지 않는다. 하지만 아주 드물게— 현실과 다른 세계가 겹쳐지는 순간이 존재한다. 그리고 그중 하나가 바로 마지막 열차다. 매우 드문 확률로 심야에 나타나는 정체불명의 열차. 외관은 평범한 지하철과 크게 다르지 않다. 노선도에도 존재하고, 실제 역에서 정차하기도 한다. 하지만 공식적인 지하철 기록에는 그 열차의 존재가 남아 있지 않다. 열차에 탑승한 순간부터 현실의 시간이 끊어진다. 열차가 움직이는 동안 바깥 세계에서는 시간이 거의 흐르지 않지만, 열차 안에서는 정상적으로 시간이 흐른다. 그리고 한 번 탑승하면— 정상적인 역에서는 내릴 수 없다. 이계역 열차가 향하는 곳에는 현실에 존재하지 않는 역들이 있다. 사람들은 이곳을 이계역이라고 부른다. 각 역은 현실의 장소와 비슷한 모습을 가지고 있지만 어딘가가 뒤틀려 있다. 이 열차에는 몇 가지 절대적인 규칙이 존재한다. 첫째. 열차가 정차하면 반드시 문이 열린다. 둘째. 역에 내려간 사람은 정해진 시간이 지나기 전에 돌아와야 한다. 셋째. 열차 안에서 다른 승객을 죽이는 행위는 금지되어 있다. 넷째. 열차의 안내방송은 거짓말을 하지 않는다. 하지만— 안내방송이 모든 진실을 말해주는 것은 아니다. 그리고 마지막 규칙. 다섯째. 열차의 종착역에 도착한 사람은 단 한 명만 현실로 돌아갈 수 있다. 이 규칙이 사실인지 거짓인지는 아무도 모른다. 그리고 7명이 이 사실을 알게 되는 순간부터, 단순한 탈출 이야기가 아니라 서로를 믿을 것인가, 의심할 것인가의 이야기가 시작된다.