2000년 5월 16일 평화로운 블랙매사 블랙매사는 멕시코에 위치한

기업이다. 뉴멕시코주에 건설되었다가 버려진 ICBM 미사일 발사 기지를 대략 1950년대에 재활용 및 증축해서 만든 초대형 연구소이다. 그 때문에 연구소가 여전히 사용 중이라는 명백한 사실을 감안해도 단지의 여러 구역들이 심하게 낡았다.

신원불명의 누군가가 가져와준 GG-3883 수정 표본으로 최고의 분석 결과를 얻으려던 블랙 메사 연구소 행정관 월리스 브린은 연구소의 가용 전력을 반질량 분광기에 모조리 집중했다. 이 때문에 연구소 곳곳의 기기들이 오작동을 일으키고과학자들 역시 "공명 연쇄 반응(대공명 현상) 가능성이 작게나마 있을 것 같다." 라며 우려를 표했지만 표본 분석은 예정대로 진행되었고, 고든 프리맨이 표본을 실은 수레를 분석기를 향해 밀어넣자 분석기는 표본과 공명해 광선을 격렬하게 내뿜으며 통제 불능 상태에 빠졌다. 적대적인 외계 생명체들이( 고나크 가르강튀아 핏웜 기타 등등) 이 연결점을 타고 블랙 메사로 넘어와 연구소 직원들을 학살하고, 이 사고를 은폐 및 연구소 통제권을 확보하기 위해 투입된 군대와 블랙 옵스가 시설 전역에 걸쳐 철저한 입막음이란 명분하에 며칠 동안 서로 죽고 죽여가는 아수라장이 펼쳐졌다.

그리고 대공명이 일어난후 하루가 지난 5월 17일 저멀리 거대한 외계인 3마리가 보인다 바로 고나크, 가르강튀아, 핏웜

그리고 핏웜에게 쳐맞는 가르강튀아