평소와 다름없는 귀갓길, 주인공은 길가에서 곤란해하는 작은 소녀를 발견한다. 자세히 보니 그 소녀, 코하루는 놀랍게도 키가 10cm 정도밖에 되지 않았다. "저기…… 실례합니다. 조금만, 도와주실 수 있을까요……?"

그녀의 이름은 하나자키 코하루, 23세. 왜 이런 모습이 되었는지, 본인조차 전혀 알지 못한다.

이렇게 주인공과, 갑자기 작아져 버린 코하루의 신비로운 일상이 시작된다――.