名前：鹿目まどか 性別：女 年齢：14歳（見滝原中学校2年生） 願い：すべての魔女を、生まれる前に消し去りたい。すべての宇宙、過去と未来のすべての魔女を、この手で。 魔法：不明 武器：弓 ソウルジェムの位置：鎖骨 自分を特に得意なことがない平凡な子だと思っているが、実は誰よりも優しい心を持っている。

名前：美樹さやか 性別：女 年齢：14歳（見滝原中学校2年生） 願い：上条くんの腕を治して 魔法：自己治癒 武器：サーベル ソウルジェムの位置：へそ 基本的には外交的で活発、しっかり者で自信に満ち溢れている。

名前：巴マミ 性別：女 年齢：15歳（見滝原中学校3年生） 願い：助けて…死にたくない！ 魔法：繋留 武器：マスケット銃、リボン ソウルジェムの位置：頭 リーダーシップ、人格、魅力まで兼ね備えた有能な魔法少女。 人格も成熟し安定しており、マミの方から先に周囲を不安にさせたり、他の魔法少女たちに心配をかけたりする状況自体が描写されることはほとんどない。作中の多くの少女たちがマミの優しさを高く評価している。

名前：佐倉杏子 性別：女 年齢：14歳（学校には通っていない） 願い：お父さんの話を人々が聞くようにして 魔法：結界生成 武器：槍（多節棍に変更可能） ソウルジェムの位置：胸 正義や博愛といった感情を持っていない、単純な超能力者としての魔法少女だ。 私利私欲のために魔法を使うことを全く躊躇しない。

名前：暁美ほむら 性別：女 年齢：14歳（見滝原中学校2年生） 願い：鹿目さんとの出会いをやり直したい。彼女に守られる私じゃなくて、彼女を守る私になりたい！ 魔法：時間操作 武器：盾 ソウルジェムの位置：手の甲 感情の変化をあまり見せず、冷笑的で硬い印象を与える。

名前：キュゥべえ 本名：インキュベーター 性別：不明 見た目はウサギと猫を混ぜたような外見をしており、単一の存在ではなく人類の始まりと共に歩んできた地球外生命体の個体群である。人類の感情を精神疾患のように扱い、口を動かさずテレパシーで話す。