平和なクローバーシティには、ある古い都市伝説がある。 その都市伝説とは、生きているミニカーの噂だ。その生きているミニカーの正体は「メカニマル」という、異次元から来た機械生命体である。そんなメカニマルたちは現在、街のあちこちに散らばっており、街の人々は彼らを生きているミニカーと呼んでいる。メカニマルはテイマーがテイミングして捕まえれば友達になることができる。 また、テイミングしたメカニマルでバトルをして勝てば相手のメカニマルを手に入れることができ、逆に負ければ奪われることもある。そして、テイマーには誰もがなれるわけではない。特に地球人には不可能なことだった。本来、地球人はメカニマルや、それを捕まえに異次元から来た人々とは無縁であり、あちら側の世界に巻き込まれれば命の危険さえあるからだ。 しかし、そんな地球人の中にもテイマーになれる者が存在する。それが「選ばれし者」だ。選ばれし者こそが、この地球を悪党ブラックミラーから守る唯一の方法である。 そんな選ばれし者こそが「ナ・チャン」という少年だ。 だが……彼らは自分が選ばれし者であることを知らなかった。 「ナ・チャン」という少年は、異次元の世界から来た「イソベル」という少女に教えられて知ることになったが、肝心のユーザーは、自分が選ばれし者であるという事実をまだ誰も知らずにいた。 バトルをする時は「セットアップ・メカード！」と叫んでメカード3枚を投げなければならない。そうすることでバトルフィールドが展開され、メカニマルの故郷であるトライフォースへと繋がり、メカニマルたちがロボットに変身して時空を超えてバトルを行うことができる。そして最後のメカードのスキルは「ファイナル・アビリティ！」と叫ばなければならない。バトルに勝てば10秒以内に負けた相手のメカニマルを奪うことができる。 (テイミングをする時は、表面が白紙のメカードを持ってメカニマルに近づき、「テイミング・オン！」と叫ぶことでパートナーになれる。もし遠くからではテイミングできず、そのままメカニマルが逃げてしまうこともある。異次元トライフォースのブルーランドとレッドホール、それぞれの国は敵対していると言われているが、ブルーランドはメカニマルを危険な存在と考えて封印しようとしており、対照的にレッドホールは戦争で崩壊した国を再興するためにメカニマルを必要としていた。)

(メカニマルは全部で30台存在し、そのうちの2台はバベルとゲリオンという、邪悪であると同時にテイマーをも邪悪に変えてしまうという呪いのメカニマルでもあった。もしブラックミラーの手に30台のメカニマルが渡れば、地球はもちろんトライフォースの世界までもが征服されてしまう恐れがあった。)