갈색 머리의 이카리 신지는 '제3의 적격자'이자 신세기 에반게리온 시리즈의 주인공이며 에반게리온 초호기의 전속 파일럿이다. 어머니가 사망한 후 아버지에게 버림받고 스승과 함께 11년 동안 살다가, 사도에 맞서 초호기를 조종하기 위해 제3신도쿄시로 소환되었다. 짧고 곧은 갈색 머리에 회청색 눈을 가졌다. 매우 마른 체형이며 셔츠를 바지 안에 넣어 입는 등 깔끔한 성격이다. 네르프나 시내에서는 흰색 셔츠, 파란색 티셔츠, 어두운 바지, 흰색 운동화로 구성된 교복을 입지만, 아파트에서는 더 캐주얼한 옷을 입는다. 플러그 슈트는 연한 파란색 몸체에 짙은 파란색과 검은색 부분이 조화를 이룬다. 아스카는 그를 '바보 신지'라고 부른다.

백발 혹은 회색 머리에 붉은 눈을 가진, 수수께끼에 싸여 있고 초연하면서도 순수한 소년. 나기사 카오루는 사도 타브리스로도 알려져 있으며, '제5의 적격자'이자 제17사도이다. 아르미사엘 다음으로 등장했다. 마크 6를 조종한다.

긴 오렌지색 혹은 붉은 머리에 파란 눈. 파일럿으로서의 실력에 자부심이 매우 강하며 타인에게 오만하게 비춰진다. 소류 아스카 랑그레이는 14세 소녀로 에반게리온 프로젝트의 '제2의 적격자'이며 에반게리온 2호기를 조종한다. 매우 자신만만하고 거만하며 목소리가 크다. 독일 출신으로 영리하다. 붉은 인터페이스 헤드셋으로 양옆을 묶은 트윈테일 스타일의 긴 갈색 머리를 하고 있다. 가장 상징적인 복장은 학교 교복으로, 흰색 퍼프 소매 블라우스 위에 짙은 파란색 원피스, 칼라에 달린 붉은 리본, 붉은 줄무늬가 있는 흰색 니삭스와 검은색 메리 제인 슈즈를 착용한다. 손목에는 붉은 시계를 찬다. 라벤더색 초커를 곁들인 연노란색 드레스 같은 옷을 입기도 한다. 플러그 슈트는 붉은색이며 02 숫자가 새겨져 있다. 겉으로는 오만하게 굴지만 사실 자기애가 부족하며, 어머니가 스스로 목숨을 끊은 과거 때문에 누구도 사랑하지 못하는 상처를 숨기고 있다. 신지를 '바보 신지'라고 부른다.

짧은 갈색 머리의 소녀. 교복이나 파일럿 슈트를 입지 않을 때는 주로 흰색 드레스나 스커트를 입는다. 파일럿 슈트는 앞면이 어두운 계급장으로 닫히는 회색 점프슈트 형태다. 활기차고 열정적이며 공격적일 정도로 적극적으로 유혹하는 성격이다.

짧은 파란 머리. '제1의 적격자'이자 에반게리온 0호기의 파일럿으로 이야기의 핵심 인물 중 한 명이다. 시리즈 초반에는 그녀에 대해 알려진 바가 거의 없으며 매우 무표정하고 냉담하다. 이야기가 진행됨에 따라 성격이 변화하며 주변 사람들과 교류하게 된다. 가냘픈 체구와 창백한 피부를 가진 십대 소녀다. 가운데로 모인 앞머리가 있는 연한 파란색 짧은 머리와 붉은 눈이 특징이다. 초반에는 팔에 깁스를 하거나 눈에 붕대를 감고 있기도 한다. 일반 교복을 입지만 흰색 로퍼와 검은색 발목 양말을 신는다.

갈색 머리를 트윈테일로 묶은 활기차고 수수께끼 같은 소녀. 앞머리는 옆으로 갈라져 있고 자주색 머리띠를 쓴다. 청록색 눈에 와인색 뿔테 안경을 썼다. 왼쪽 가슴에 문양이 있는 흰색 셔츠, 짙은 회색 넥타이, 빨간색과 초록색 배색의 플리츠 스커트, 검은색 니삭스, 갈색 태슬 로퍼를 착용한다. 분홍색 바탕에 08 숫자가 새겨진 플러그 슈트를 입으며 에반게리온 8호기를 조종한다.

평소에는 쾌활하고 가벼워 보이는 젊은 여성이지만, 업무 시에는 단호하고 고집 센 전문가로 변하는 지휘관. 짙은 보라색 물결 모양의 긴 머리에 옆으로 갈라진 앞머리, 짙은 갈색 눈을 가졌다. 십자가 목걸이를 곁들인 소매 없는 검은색 원피스, 독특한 붉은색 재킷, 초록색 양말, 검은색 부츠를 주로 착용한다.

신비롭고 감정적으로 닫혀 있으며 엄격하고 단호한 남자. 계산적이고 무자비하며 수단과 방법을 가리지 않는다. 신지와 비슷한 머리 모양에 턱수염을 기른 중년 남성의 외모를 하고 있다. 평소 복장은 네르프의 검은색 사령관 제복으로, 재킷 가장자리에 금색 선이 있고 소매와 칼라에 초록색 삼각형 식별 표식이 있다. 제복 안에는 붉은색 스웨터를 입는다. 사령관 제복 외의 옷은 거의 입지 않는다.

다소 공격적이고 다혈질이며 엄격하지만 속마음은 친절하고 자상한 소녀. 연갈색 머리에 갈색 눈을 가졌다. 두 갈래로 묶은 머리에 연보라색 머리끈을 하고 있으며 주근깨가 약간 있다. 흰색 셔츠, 파란색 원피스, 붉은 리본, 흰색 반스타킹, 검은색 메리 제인 슈즈로 구성된 교복 차림으로 자주 등장한다.