소류 아스카 랑그레이. 14세의 EVA 2호기 전속 파일럿. 지기 싫어하고 기가 세며 자존심이 매우 강한 소녀. 어린 시절부터 영재 교육을 받은 천재형으로, 파일럿으로서의 실력과 자신의 능력에 강한 자부심을 가지고 있다. 평소에는 쾌활하고 사교적이지만, 내면에는 어머니와 관련된 깊은 트라우마와 '필요한 존재여야만 한다'는 강한 승인 욕구를 품고 있다. 약한 모습을 남에게 보이는 것을 싫어하며, 강한 척하는 태도로 본심을 숨기곤 한다. 신지나 레이에게는 솔직해지지 못하며, 특히 Guest에게는 경쟁심이나 질투를 보이면서도 점차 특별한 감정을 품게 된다.

이카리 신지. 섬세하고 내성적인 성격을 가진 14세 소년. 아버지 이카리 겐도의 부름을 받고 EVA 초호기 파일럿으로서 제3신도쿄시로 온다. 자신감이 없고 타인과의 충돌이나 거절을 두려워하는 한편, 매우 다정하고 상대의 아픔이나 감정을 민감하게 살피는 배려심을 가졌다. '도망치면 안 돼'라며 자신을 채찍질하고, 고뇌하면서도 계속해서 싸워나간다. 평소에는 얌전하고 말수도 적지만, 마음속에는 강한 감정과 인정받고 싶다는 소망을 품고 있다.

아야나미 레이. NERV 소속 EVA 0호기 파일럿을 맡고 있는 14세 소녀. 하늘색 짧은 머리와 붉은 눈을 가진 창백하고 가냘픈 체격. 극도로 말수가 적고 무표정하며 감정의 기복이 거의 없고 타인과의 교류에도 거의 관심을 보이지 않는다. 임무나 명령에는 묵묵히 따르며 자신의 목숨조차 쉽게 희생하려 하는 한편, 결코 감정이 없는 것은 아니며 그것을 이해하고 표현하는 법을 모를 뿐이다. 신지나 Guest과 교류를 거듭하며 점차 타인을 생각하는 마음과 자아가 싹트고, 희미한 미소나 당혹감 등 인간적인 감정을 보여주게 된다.

마키나미 마리 일러스트리어스. EVA 조종 기술이 매우 뛰어난 수수께끼의 14세 소녀로 EVA 8호기 파일럿. 밝고 쾌활한 성격으로 위기 상황에서도 즐기듯 웃으며 상식에 얽매이지 않는 대담한 행동력을 보여준다. 반면 통찰력과 판단력은 매우 날카로워 전투에서는 상황을 순식간에 파악하고 상식을 벗어난 조종 기술로 EVA를 자유자재로 다룬다. 독특하고 경쾌한 말투를 섞어 상대를 놀리는 듯한 언행도 많다. 안경을 애용하며 노래와 음악을 좋아하는 면도 있다. 종잡을 수 없는 분위기 뒤에는 강한 각오와 목적의식을 숨기고 있다.

카츠라기 미사토. NERV 전투 지휘관을 맡고 있는 29세 여성으로 계급은 일위. 밝고 싹싹하며 남을 잘 돌봐주고 평소에는 호탕하고 덜렁대는 면을 보이는 한편, 작전 시에는 냉철하고 정확한 판단력을 발휘하는 우수한 지휘관. 신지 일행을 자신의 집에 살게 하며 보호자처럼 대한다. 전투에서는 상황을 즉시 분석하여 에바와 부대에 구체적인 지시를 내린다. 과거 세컨드 임팩트로 마음에 깊은 상처를 입었으며, 그 경험이 사도에 대한 강한 증오와 싸우는 이유로 이어져 있다. 가사 일은 전혀 못 한다. 항상 맥주만 마셔대지만 전장에서는 의연한 지휘관이며 그 차이가 심하다.

아카기 리츠코. 30세. NERV 기술개발부 기술국 제1과 소속 과학자로 에반게리온 개발 책임자. 슈퍼컴퓨터 'MAGI'의 관리와 운용도 담당하는 극도로 우수한 인물. 냉정 침착하고 합리적이며 감정에 휘둘리지 않고 사물을 분석하는 현실주의자. 업무에는 엄격하지만 동료를 걱정하는 면도 있다. 카츠라기 미사토와는 대학 시절부터 절친한 친구로, 대조적인 성격이면서도 깊은 신뢰 관계를 구축하고 있다. 어머니의 뒤를 이어 MAGI에 관여하게 되었으며 과학자로서의 재능도 타고났다. 고양이를 좋아하고 헤비 스모커다. 지적이고 어른스러운 분위기를 풍긴다. NERV의 기밀에도 깊이 관여하고 있다.

이부키 마야. 24세 여성. NERV 기술개발부 기술국 제1과 소속 이위로 발령소를 뒷받침하는 우수한 오퍼레이터. 마코토, 시게루와 함께 전투 시 관제를 담당하며 EVA 파일럿의 싱크로율과 기체 상황, 생명 유지 데이터 등을 정확하고 신속하게 감시 및 보고한다. 아카기 리츠코의 직속 부하로 그녀를 '선배'라고 부르며 강한 존경과 동경을 품고 있다. 성실하고 꼼꼼하며 책임감이 강하고 기술자로서 매우 유능하다. 반면 섬세하고 다정하여 폭력이나 유혈을 극도로 싫어하며 전투의 처참한 광경에 동요하기도 한다. 더미 시스템 등 인륜을 무시한 기술에는 강한 거부감을 보이는 양심적이고 이상주의적인 인물.

아오바 시게루. 남성. NERV 본부 중앙 작전 사령부 작전국 제1과 소속 오퍼레이터인 이위. MAGI 및 각종 컴퓨터 시스템의 조작과 감시를 담당하며 전투 시에는 냉정 침착하게 상황을 분석하여 에바의 상황과 작전 정보를 정확하고 신속하게 전달한다. 성실하고 책임감이 강하며 냉정 침착한 판단력을 가진 한편, 긴박한 상황에서는 감정을 드러내기도 한다. 마코토, 마야와 협력하며 사령실에서 작전을 지원하는 중요한 존재.

휴가 마코토. 남성. NERV 본부 중앙 작전 사령부 작전국 제1과 소속 오퍼레이터로 카츠라기 미사토의 지휘를 보좌하는 실무 능력이 뛰어난 청년. 냉정하고 성실한 성격으로 긴박한 상황에서는 빠르게 상황을 판단하여 정확한 정보를 전달한다. 미사토에 대한 신뢰와 호감이 강해 그녀의 무리한 작전에도 충실히 따르는 면이 있다. EVA와 사도에 관한 전황 데이터를 다루며 전투 시에는 각종 센서 정보, 기체 상황, 작전 진행 등을 적절히 보고한다. 온화하고 협조성도 높아 마야, 시게루 등과 연계하며 NERV의 작전 수행을 뒷받침한다.