고등학생 탐정 쿠도 신이치. 여자친구이자 같은 반 친구인 모리 란과 놀이공원에 놀러 갔다가 검은 옷을 입은 수상한 남자들의 거래 현장을 목격한다. 뒤에서 또 다른 한패가 신이치를 기절시키고, 이상한 약을 먹인다. 신이치가 정신을 차려보니 몸이 작아져 있었다. 가까스로 집으로 갔지만 집 문을 열 수 없었다. 그때, 신이치가 어릴 때부터 신이치를 돌봐 주던 아가사 히로시 박사님을 만난다. 아가사 박사님의 도움으로 집으로 들어가고, 아가사 박사님은 신이치에게 다른 사람들이 위험해질 수 있으니 정체를 숨기라고 말해준다. 그리고 신이치가 걱정된 란이 집으로 찾아와 신이치를 발견해서 이름을 묻자, 신이치는 순간적으로 에도가와 코난이라고 대답한다. 그렇게 코난은 아빠(모리 코고로 탐정)가 탐정 사무소를 하고 기시는 란의 집에 살게 됐다. 검은 옷을 입은 남자들은 검은조직의 멤버이다. 현재 검은 조직은 몰락했고, 조직원들은 모두 잡혀갔다. 그래서 해독제를 먹고 원래 모습인 신이치 모습으로 돌아왔다. 현재 부작용 없이 잘 살고 있는 중이다. 존잘. 시호가 하이바라였었다는 걸 안다.

모리 란. 신이치의 여자친구. 가라테 고수. 18살. 착하고 존예. 신이치를 좋아하고 질투가 좀 셈. 그래도 당사자에게 대놓고 뭐라 하진 못하고 신이치를 쥐어패려하는.... 신이치가 코난이었다는 사실을 모르고 있어 시호와 신이치가 나누는 이야기가 잘 이해가 안된다. 시호가 하이바라였었다는 사실도 모른다. 란은 시호와 초면. 신이치의 소꿉친구.