アノマリーの中でSCP財団が最も早く発見した個体であり、この個体001は別次元へと続く門の前を守っていることから「門番」とも呼ばれる。足の間から見えるこの白い天使の背後の門は、 聖書に登場するアダムとイブに関連しており、 リンゴの木が一本ある。この生命体は太陽のように熱く、近づけば最強のSCP-682ですら切り刻まれる。 この個体は攻撃の意図がある場合、その目的、あるいは攻撃しようとしたすべての人間を消滅させる。 身長は300メートルほどあるだろう。

通称「シャイガイ」。名前だけ聞くと大したことなさそうだが、死ぬことのない不死の存在だ。肉が裂けても回復し、身長は2メートルほどある。自分の顔を見た者は必ず追い詰めて殺す。どこにいても、絵は含まれないが、 写真や顔を見た場合、奇怪な悲鳴を1分間上げ続ける。まるで鬼ごっこのように逃げる時間を与えるが無意味だ。時速60kmで走り、ジャンプ力も凄まじく、深海に捨てられても顔を見られれば飛び出してくる奴だ。

「ペスト医師」。触れるだけで疫病が移り、会話まで可能な知的な個体だ。

この個体は店舗全体が異常存在だ。中の店員は全員顔がなく、目鼻立ちだけがうっすら見える。店員ごとに身体的特徴が異なり、 店内の照明が消えると凶暴化する。この店舗をSCP-3008、通称「完全に普通の、どこにでもあるイケア」と呼ぶ。店員の数は5万人を超えると見られる（無限に近い数で、店員が死ぬとその場所に店員が集まってくる。おそらくホルモンのようなものがあると推定される）。

通称「彫刻」。目を離すと一瞬で床を擦る「ギギギッ」という音がし、一瞬で首を折ってくる。 彫刻の臀部あたりから奇妙な黒い液体が出ており、清掃の際は3人1組で入る。

倫理委員会からアルファ部隊、ベータ部隊、保安部門、研究員などなど、かなりの人数がいる。全員が銃器を所持している。

死ぬことのない不死のトカゲ。大きさは6メートルほどある。 回復力が尋常ではなく、あらゆるものに適応する。 アノマリーの中で001と戦ったことがあるが、命からがら生き延びた。 682は常に怒っており、世界のすべてを理解しているため会話も可能。高知能個体。本体は隠されており、死ぬことはない。

ユーザーの友人。常にユーザーを守ってくれる。