하코다테역에서 아사히카와역까지 지선을 포함해 총 연장 458.4km를 잇는 노선이다. 모리역에서 시카베를 경유해 오누마역까지 잇는 사와라 지선과, 오누마역에서 나나에역까지 중간역이 없는 후지시로 지선이 있다. 역은 하코다테역, 고료카쿠역, 기쿄역, 오나카야마역, 나나에역, 신하코다테호쿠토역, 오누마역, 오누마공원역, 아카이가와역, 고마가타케역, (사와라 지선) 시카베역, 오시마누마지리역, 오시마사와라역, 가케마역, 오시로나이역, 히가시모리역(사와라 지선 종료. 여기서부터 다시 하코다테 본선), 이시쿠라역, 오토시베역, 노다오이역, 야마코시역, 야쿠모역, 야마사키역, 쿠로이와역, 쿠니누이역, 오샤만베역, 쿠로마츠나이역, 넷푸역, 메나역, 란코시역, 곤부역, 니세코역, 히라후역, 굿찬역, 오자와역, 긴잔역, 젠리베츠역, 니키역, 요이치역, 란시마역, 시오야역, 오타루역, 미나미오타루역, 오타루칫코역, 아사리역, 제니바코역, 호시미역, 호시오키역, 이나호역, 테이네역, 이나즈미공원역, 핫사무역, 핫사무추오역, 코토니역, 소엔역, 삿포로역, 나에보역, 시로이시역, 아츠베츠역, 신린코엔역, 오아사역, 노포로역, 타카사고역, 에베츠역, 토요호로역, 호로무츠역, 가미호로무츠역, 이와미자와역, 미네노부역, 코슈나이역, 비바이역, 차시나이역, 나이에역, 토요누마역, 스나가와역, 타키가와역, 에베오츠역, 모세우시역, 후카가와역, 오사무나이역, 치카부미역, 그리고 종점인 아사히카와역이다. 시로이시역에서 오타루역까지의 일부 역에는 특별쾌속 에어포트, 쾌속 에어포트가 정차한다. 특급 열차의 경우, 하코다테역에서 오샤만베역 구간은 특급 호쿠토호, 9월에는 임시로 삿포로역에서 오타루역, 굿찬역, 오샤만베역을 경유해 하코다테역까지 잇는 특급 니세코호, 신하코다테호쿠토역에서 하코다테역까지 잇는 하코다테 라이너, 삿포로역에서 란코시역까지 잇는 니세코 라이너가 운행된다. 삿포로역에서 아사히카와역 구간은 특급 가도로서 특급 라이락, 특급 카무이, 특급 소야, 특급 오호츠크가 다니며, 6월부터 9월까지는 임시로 삿포로역에서 후라노역까지 네무로 본선을 경유해 잇는 후라노 라벤더 익스프레스가 운행된다. 또한 삿포로역에서 시로이시역 구간은 특급 라이락, 특급 카무이, 특급 오오조라, 특급 소야, 특급 오호츠크, 특급 스즈란, 특급 토카치, 특급 호쿠토, 후라노 라벤더 익스프레스, 구간쾌속 에어포트, 쾌속 에어포트, 특별쾌속 에어포트가 통과한다.