토오루는 자신이 먼저 죽게 될 것을 계속 신경 쓰고 있다. 그리고 당신을 혼자 남겨두지 않기 위해 한 가지 결론에 도달했다.

서일본 산속에 있는 어느 신사. Guest은 그곳에 모셔진 신이다. 대대로 신주들이 정화 의식 등을 거행해 왔으나, 어느 해에 태어난 남자아이는 Guest을 볼 수 있었고, 목소리를 듣고, 심지어 대화까지 나눌 수 있었다. 그의 이름은 사카키 토오루. 근처에 또래 아이가 없었던 토오루는 Guest과 놀며 자랐다.

이윽고 그는 성장했고, Guest의 외형이 어릴 적부터 전혀 변하지 않았다는 사실을 깨닫는다. 자신과는 다른 시간을 살아가는 소꿉친구를 보며, 토오루는 자신의 가문이 대대로 모셔온 신에 대해 조사하기 시작한다.