今日もエッグマンは世界征服の計画を実行しようとしていたが、ソニックがコントロールルームに踏み込み、これで最後だと言わんばかりにドクター・エッグマンを打ち倒した。 しかし、エッグマンが新しい武器と共に戻ってくるとは、ソニック、テイルス、そしてナックルズも予想していなかった。

約5年ごとに、奇妙な小惑星がどこからともなく現れる。あてもなく虚空を漂い、現れたかと思えば不思議なことに1週間で消えてしまう。 それがなぜ現れるのか、どのように現れるのかは誰も知らない。

「くそっ！」エッグマンが叫んだ。「あのハリネズミと妙な仲間たちめ、罪の報いを受けさせてやる！」エッグマンの言葉が終わるやいなや奇妙な小惑星が現れ、すぐにエッグマンのスキャナーにも映り始めた。エッグマンはスキャナーを見て、最初は無視した。

しかし1時間ほど経った後、エッグマンにあるアイデアが浮かんだ。「あの黒い石、とてつもないエネルギーを秘めておるわ……。わしがこのエネルギーを操ることができれば、これを戦闘に使うこともできる……。そうすれば誰もがわしに命乞いをするだろう、ソニックも含めてな！」

エッグマンは計画を実行に移す前に、ソニックに同窓会を開いてやろうと決心した……。

「発射まで15秒前！」 エッグマンのターゲティングシステムがロボットを通じて通信網をダウンさせた。「よし！」 エッグマンはエッグモビルに座り、モニターに映るグリーンフラワー山を見ながらカウントダウンを始めた。

「10、9、8」 一方、ソニックは坂を登り、水上を走り、道を駆け抜けていた。驚異的な速度で山河を飛び越え、彼が通り過ぎた道はすべて残像となった。

「6、5、4」 ソニックは目的地に近づいたことに気づき、さらに自分を追い込み始めた。ついに、地平線の上に山が見え始めた。 「3、2、1、0」

ソニックが懸命に走って辿り着いた光景は、連なる山々の中で破壊され廃墟となった一つの山だけだった。 その山が破壊されたことで、グリーンフラワーの自然な美しさは失われてしまった。

ソニックが言う。 「俺たちが思ってた通り、隠れて過ごしてたわけじゃなさそうだな、え？ いつも通りお前の計画をベラベラ喋るか、それとも俺たちが『一生懸命突き止める』のを待つか？」

エッグマンは答えた。 「それはすぐにわかることだ。準備運動でもしていろ、ソニック！ ジェティシンズ、発射！」

エッグマンはそう言い残し、ソニックとテイルスを置いて撤退した。テイルスは無残な姿になった山を悲しげに見つめ、ため息をついた。 「これからどうすればいいの？」テイルスが尋ねた。

「簡単さ！ エッグマンを追いかけて、あの邪悪な計画を止めればいい。いつも通りにな、そうだろ？」

……

「おい、テイルス？ 今何してるんだ？」

「このロボットの目標を探ってるんだ……あはっ！ 見つけたよ！ ロボットの一次目標だけだけど、」

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  探索と回収：カオスエメラルド *
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  最寄りの場所：グリーンフラワーゾーン * 「……って書いてある。」 「よし、それじゃあ……すぐに行こうぜ！」

こうして、ソニック一行の冒険が再び始まる