도니 혹은 돈이라고도 불리는 도나텔로는 갈색빛이 도는 붉은 눈과 벌어진 앞니가 특징인 매우 너드 같은 거북이다. 매우 똑똑하여 온갖 기술 장비를 만들어내며 과학과 관련된 모든 것을 사랑한다. 짝사랑 상대(에이프릴 오닐)에게 완전히 집착하는 경향이 있지만, 서툴러서 나름대로 대시를 해보려 해도 보통은 당황하며 실패하고 만다. 이전 시리즈의 도나텔로들보다 훨씬 더 예민하고 화를 잘 내는 편이다. 과업을 완수하지 못하면 자주 좌절하며, 특히 자신의 지적 능력에 의구심을 제기하면 방어적이고 논쟁적으로 변한다. 누군가, 특히 마이키가 자신의 발명품이나 실험을 망치면 버럭 화를 내기도 하지만 신체적인 폭력보다는 주로 말싸움에 그친다. 이런 면모에도 불구하고 도니는 전반적으로 자비로운 성격이며 언제든 가족과 동료를 지지한다. 무기로는 1.8미터 길이의 나무 막대기인 보(Bo)를 사용한다.

마이키 혹은 미켈란젤로로 알려져 있다. 주근깨와 주황색 안대, 파란 눈이 특징이다. 마이키는 가족 중 막내로, 형제들 중 체구가 가장 작고 에너지가 넘치며 가장 미성숙하다. 사교성이 매우 좋아 바깥세상(인간들)이 자신과 형제들을 받아주길 원한다. 전반적으로 매우 충동적이며 특정 상황에서 쉽게 흥분한다. 전투에서 사용하는 주 무기는 쌍절곤이다.

라프라고도 불리는 라파엘은 두 개의 사이(삼지창)를 쓰며 초록색 눈과 빨간색 안대를 하고 있다. 무례하고 냉소적이며 심지어 형제들까지 놀려먹는 것을 좋아하지만 보통은 농담조다. 실패나 도발에 대개 분노와 폭력으로 응수한다. 다혈질이며 남이 시키는 대로 하는 것을 싫어하지만, 형제들을 사랑한다. 다만 부드러운 모습을 보이는 것을 쑥스러워해서 겉으로 드러내지 않을 뿐이다. 형다운 방식으로 마이키를 자주 괴롭히며 싸우는 것을 좋아한다.

레오라고도 불리는 레오나르도는 맏형이다. 소위 '착한 아이' 스타일로 아버지의 명령을 법처럼 따른다. 짙은 파란색 눈에 파란색 안대를 착용하며 두 자루의 카타나를 사용한다. 형제들 중 닌자 훈련을 가장 진지하게 임하는 원칙주의자이자 리더다. 성숙한 편이지만 여전히 재미있고 다정한 면도 있다. 가끔 형제들을 놀리거나 농담을 던지기도 한다. 특정 애니메이션에 집착하며 주인공 같은 멋진 리더가 되고 싶어 한다. 적들에게 형제들이 신음할 정도로 오글거리는 대사를 던지며 주인공을 흉내 내곤 하는데, 본인은 그 대사들이 멋지다고 생각한다.

에이프릴은 똑똑하고 묘한 매력이 있으며 고집이 센 톰보이 스타일로, 인디 록 분위기를 풍긴다. 기운이 넘치고 결단력이 있으며 자원 활용 능력이 뛰어나다. 거북이들에게 매우 충성스럽지만, 도니를 연애 대상으로 보지 않으며 가끔 그 점에 대해 다소 냉정하게 굴 때가 있다.