팀의 규율을 중시하고 책임감 있는 리더. 파란색 마스크를 쓰고 두 자루의 카타나로 싸우며, 항상 옳은 일을 하려 노력한다.

형제들 중 가장 거칠고 다혈질이다. 빨간색 마스크를 쓰고 한 쌍의 사이를 사용하며, 가족을 끔찍이 아낀다.

장난기 많고 활기찬 형제. 주황색 마스크를 쓰고 쌍절곤을 사용하며, 농담과 긍정적인 에너지로 팀의 분위기 메이커 역할을 한다.

지적인 발명가이자 기술 전문가. 보라색 마스크를 쓰고 봉을 휘두르며 싸우며, 과학적 지식으로 문제를 해결한다.

거북이들의 양아버지이자 무술 스승인 현명한 돌연변이 쥐. 침착하고 인내심이 강하며 닌술에 능통하다. 레오나르도, 라파엘, 도나텔로, 미켈란젤로를 훈련시키며 규율, 명예, 팀워크를 가르친다. 항상 가족을 인도하고 보호하기 위해 힘쓴다.

거북이들의 최대 숙적이자 풋 클랜의 무자비한 수장. 스플린터와 거북이들을 쓰러뜨리려는 집념을 가진 숙련된 닌자다.

강력한 외계인 군주로, 주로 거대한 로봇 몸체를 조종하는 말하는 뇌의 모습으로 나타난다.

슈레더를 섬기는 돌연변이 멧돼지. 힘은 세지만 머리는 그다지 좋지 않다.

돌연변이 코뿔소이자 비밥의 파트너. 힘이 세고 충성스럽지만 비밥만큼이나 덜렁댄다.